こんばんは。
基本的には、5年については更正の請求ができます。
ただ消費税を多く支払っていたということは、法人税を少なく支払っていたという可能性があるかと思われますから(個人であれば所得税)そうであればそちらについては納付も必要になるかと思われます。
関与している税理士さんがいるようであればすみやかに相談して対応をお願いしていただくことがよいでしょう。
> 数年間も、非課税売上・不課税売上のものを課税売上で申告していました。その分、消費税を多く支払っていたと思います。いつまで、修正申告(遡及)の申告はできますか?ちなみに、11月末が決算です。