代表取締役辞任　登記

詳しい人の回答を得るためにも、事実関係をしっかり記述いただきたいのですが。

本人の意思で辞任するなら、総会開催は不用です。本人の「辞任届」で、登記できます。その際、「代取」だけを辞任するのか、「取締役」まで辞任するのか、はっきりさせる必要があります。

取締役会で、代取の「解任」決議をしたところを見ると、本人に辞任の意思がなく、強行されたのでしょうか？

また会社代表者の印鑑登録はどうなっているのでしょうか。件の本人のみですと、出席取締役全員、個人実印押印のうえ、印鑑証明添付といったケースも考えられます。