勤怠管理について

勤怠管理について、他社さまではどのように行っているか気になったため投稿させていただきます。

弊社は50人ほどの会社ですが、部署によりシフト制、休日出勤や直行もあり、勤務の状況は様々です。

現在は
・社員は毎日タイムカードを打刻
・直行や休日出勤、残業などカードで分からない情報については別紙の実績表に記入
・勤怠締めで上記2つを提出してもらう
・総務で部署ごとにまとめたエクセルの表を作成、各部の上長に確認

という流れで勤怠の管理を行っていますが

・タイムカードの保管の問題
・実績表の記入の煩雑さ、カードとの整合性が合わないミス
・エクセル入力の手間

などがあり、サイボウズなどの機能でこれらをまとめてwebで入力、提出してもらう方式に切り替えようか検討中です。
検討の過程で気になったのですが、他社ではどのように勤怠管理を行っているのでしょうか？
担当者の方にかぎらず、うちはこうしていますよ～というお話を聞かせていただけると嬉しいです。