請求・回収

今までエクセルで手作業で行っていた請求日の管理、請求書の作成から、回収日の管理をソフトを使用して行おうと言われました。

弊社は、ソフトウェア開発を業としています。

特定派遣等もしており、一式金額の請求もあれば、契約で定めた基準時間満たない場合に一式金額からその時間分を減額（値引きではないです）し請求したりします。

後者の例をあげますと、特定派遣先にて1か月160時間～180時間勤務することを契約で定め、それに満たない場合は、その時間分を減額時間単価を用いて一式金額から控除することや、時間超過した場合は、超過時間単価を用いてその時間分を一式金額に上乗せして請求することがあります。

どのソフトも回収や請求日のスケジュール管理ができるのはわかったのですが、請求書や見積書を出力する際に単価等を設定した情報以外に、直接入力できるようなソフトを探しています。
弥生販売や請求応援等を請求書管理ソフトを見つけたのですが、これらはそのようなことができるのでしょうか。

他にお勧めソフトがあれば教えてください。