公益法人の支部会計について

支部の組織がどのような構成をとっているかによります。
当該支部の支部長などが、本部より任命されるのであれば、
社団法人の一部署と考えられますから、本部の会計とあわせて
計上する必要があります。

しかし、もし支部長が支部構成員の選挙等で選任され、
本部とは別に総会を開き、決算も独自に行うということで
あれば、それは本部とは独立した団体（権能なき社団）と
考えられます。この場合、収益事業を行っていれば、別途確定
申告等を行う必要があります。

詳細は個別ケースにもよりますから、管轄の税務署へご相談
されたほうがよろしいかと思います。

行政書士武田法務事務所 様

ご回答いただきましてありがとうございます。
当方は本部とは独立した団体とおうことが
わかりましたので、税務署へ相談してみます。