受取手形の残高がマイナス

ありえそうなところでいえば、受け取った手形の入力漏れ、勘定科目の間違いでしょうか。

どのように管理されているのかわかりませんが、取立に出した記録はあるのに受取の記録がない手形がないか、確認してみてはいかがでしょうか。
また、そのような場合は売掛金が滞留状態になっていると思われます。
あわせて、売掛金が滞留していないかも確認してみましょう。

勘定科目の間違いの場合、他の科目で合わない部分が出てきますので、元帳を確認すればわかるかと思います。

ご回答を、ありがとうございます。
取立に出した記録はあるのに受取の記録がない手形がないか、確認してみます。それでも解決しなかったら、又アドバイスお願いします。ありがとうございました。

取立に出した記録はあるのに受取の記録がない手形を、確認しました。
受取手形の補助科目にでんさい・手形があるのですが、でんさいで受け取ったものを手形で計上していたことが分かりました。
大変、助かりました。ありがとうございました。