自社発行の請求書の保管について

データーが残存していれば、問題はありません。
請求書も年度ごとのナンバー控え（連番）があるはずです。
通常、請求は時効が1年ですが、未入金に対抗するために７年半以上保存すれば良いともいます。
これは、売掛決済等で中長期にわたる場合もあります。
ただし、税法上で定められた期間がありますから、最長は７年間保存します。
今では、保管場所等の設置にたいへんですから、通常はデーター保管していますね。これも規則等で、重要帳票類のデーター保管保存規則により行っています。
必要の際、プリントアウト後、捺印使用しています。

＜　帳簿書類の保存期間　＞
http://www12.plala.or.jp/gocho/hozonkikan.html

akijinさん 回答ありがとうございました。

データは保存してありますし年度ごとののナンバー控えもありますので、問題なさそうです。

URLもとても参考になりました。

ありがとうございました。