こんにちは、かんなるさん。
さて、ご質問の件、以下の通り回答いたします。
Q.トライアル雇用で、常用雇用した社員を会社都合で退職させる場合、会社側に不利益になる事はありますか?
A.何を持って「不都合」と考えるかによって回答は異なります。が、一般論で言えば各種助成金を受給できなくなることでしょうか。
余談ですが、
> 雇用期間は、トライアル期間を含めて1年1ヶ月です。
とありますが、形式や呼称(トライアル期間)に関わらず、『雇用』したことに違いはありません。
特段の定めがあるものを除き、通常の解雇と同じように扱う必要はあるでしょう。
以上