出勤簿の扱いについて

私見ですのでご容赦を。

文面から読み取れない部分があるのですが、主任が職員に命じて、職員の方に労働者の出退勤時間を記入させているのでしょうか。
当人のもの＝主任の押印ともとれますし、
当人のもの＝勤務した職員本人の押印ともとれます。

時間外労働を含め全ての出退勤を会社が命じて出勤簿に記入し、労働者がその時間を確認するのであれば、記入を命じられた職員が記入し、労働者がそれを間違い無いと確認して日々押印するのは良いのではないかと思います。

全ての出退勤を労働者本人が記入、押印し、会社が間違い無いと確認するのであれば、それはまたそれで良いのではないかと思います。

日々の出退勤時間が間違い無く記入されていて、労働者本人が確認して日々押印され、賃金支給の単位で会社が確認して最終確認として確認欄に会社側（課長でしょうか）が押印されていればよろしいのではないかと思います。