経理上の不正かもしれない行為

私個人の見解です。

ホントに、単に支払先として妹さんの名前が使われただけ？？
ま、それはともかくとして…

雑費で処理されているとの事ですが、支払い目的（摘要欄）には、何と記載されているのでしょうか？
給与ならば、「扶養控除申告書」があれば、課税対象金額ではありません。
なければ、課税（源泉税）の対象になると思いますので、源泉徴収し、納税し、源泉徴収票の発行が必要かと思います。
そして、妹さんは確定申告が必要かな。
そして、会社としては領収証が必要。

その他諸経費として支払われたならば、領収証がきちんとあれば、特に問題ないと思われますが。
会計士等の監査も大事ですが、税務署の監査が入いった時の対策を考えるべきですね。
会計士の方にきちんと正直に伝えておくほうが良いと思います。

ご案内があるようですが、もしかした「架空経費処理」を行っているかもしれませんね・
親子親族関係会社内ではよく生ずる行為ですね。
あるいは税務調査で厳しくチェックされるかもしれません
使途要件が適切でなければ税務調査も厳しくなりますよ。

架空処理っぽいです。
お金は支払われてはいませんでした。
この場合どうなるんでしょう？

会計士さんに正直に話して、指示を仰ぐべきです。

これが、賢明な対処法です。