個人で確定申告する場合、年末調整は．．．

平成23年給与所得者の扶養控除等（異動）申告書が提出されているのであれば、年末調整をしなければなりません。（中途退職の例外あり）

保険料申告書提出の有無は、年末調整をする・しないとは関係ありません。

保険料控除申告書を勤務先へ提出する・しないは本人の自由です。

ご回答いただきありがとうございました。

会社で年末調整をした源泉徴収票を基に、確定申告で保険料等の控除を受け、最終的に年間の所得税が計算される　という理解でよろしいですか？

> 会社で年末調整をした源泉徴収票を基に、確定申告で保険料等の控除を受け、最終的に年間の所得税が計算される　という理解でよろしいですか？

そのとおりです。

実際の処理の中でいろいろな疑問が生じており一つずつ解決しております。回答いただきとても助かりました。
ありがとうございました。