複数に別けて入金があった場合

通帳記載に合わせるのであれば、後者でしょう。。。

会社がわかるのであれば、どちらでも、、、
分割して振り込まれるのはその会社だけですか？
部署ごと管理されるのであれば、後者の方が良いでしょう。。摘要欄にもそれぞれ記入してください。

ちなみに、他社のことなので突っ込みすぎてもいけませんが、、
部署ごと入金されていれば、相殺されている手数料も高くなりませんか？
振込方法について、再度先方と確認してみてください。（契約内容など）



> 売上はすべて
> 売掛金/売上で立てています。
>
> 売掛金の消込は諸口ではなく
>
> 預金　/　売掛金
> 手数料/
>
> で処理しています。
>
> １件の売上に対して、お客様が部署ごとで按分して入金してきます（同日）
> この場合は入金額毎に
>
> 預金　/売掛金
> 預金　/
> 預金　/
> 手数料/
>
> と仕訳すべきでしょうか。
> もしくは、合算して
>
> 預金　/　売掛金
> 手数料/
>
> で良いのでしょうか。

回答ありがとうございます。

都合上、手数料をひかれた形でかきましたが、実際は相手負担ですので手数料は発生しておりません。
紛らわしくて申し訳ありませんでした。

> 回答ありがとうございます。
>
> 都合上、手数料をひかれた形でかきましたが、実際は相手負担ですので手数料は発生しておりません。
> 紛らわしくて申し訳ありませんでした。


振込方法についても、契約内容によりますので、再度ご確認してください。
先方の管理方法だけで、貴社が困らないのであれば、一括振込の契約も相談してみてはいかがでしょうか？

回答ありがとうございます。

振込方法の変更はできないといわれております。
情報が不足しており申し訳ありません。

> 回答ありがとうございます。
>
> 振込方法の変更はできないといわれております。
> 情報が不足しており申し訳ありません。
>
御社がどのように管理するか、、、ですが、
通帳記帳漏れ、入力漏れを考えるのであれば、合算よりそれぞれで伝票入力しておくと後でチェックは楽です。。（合算額が間違っていた、手数料分が引かれていた、、などなど）
必ず通帳残高と元帳が一致しますので、、、どちらにしても漏れがなく、御社において誰が見てもわかるように処理しておくことが良いと思います。。。

どちらが間違いということはありません。
御社が管理しやすい（見やすい）方法を。。。