時間外勤務について

> 社員が時間外勤務をした場合、その時間分、他の日に遅く出勤しり、早く帰ることで調整するのは違法でしょうか？
> 社員の健康を考えると、その対応の方が良いのではないかと考えます。労使協定を締結すれば認められますか？ご回答頂きたくお願いいたします。

25%分の割増未払いとなることも含め、法令違反となるため
認められないと思います

> 社員が時間外勤務をした場合、その時間分、他の日に遅く出勤しり、早く帰ることで調整するのは違法でしょうか？
> 社員の健康を考えると、その対応の方が良いのではないかと考えます。労使協定を締結すれば認められますか？ご回答頂きたくお願いいたします。

所謂「フレックス」でしょうか？であれば可能だと思います。

> 社員が時間外勤務をした場合、その時間分、他の日に遅く出勤しり、早く帰ることで調整するのは違法でしょうか？
> 社員の健康を考えると、その対応の方が良いのではないかと考えます。労使協定を締結すれば認められますか？ご回答頂きたくお願いいたします。

こんにちは。
数字を使って説明します。
時給１０００円の人がいたとします。

この方が２時間残業すると、
（1000×1.25）×2＝2500円
この方の通常の勤務
1000×２＝2000円

つまり５００円分が支払われないという事で、違法となってしまいます。

深夜残業などした翌日に、遅い出勤を認めてあげることは良いことです。
でも給与の相殺は出来ないのです。