研究（修士・博士）出身の社会人育成

全般的に、何がタメとしてがわかりませんが、教育や指導ということであればダメとされていることについての１つ１つに対応が必要になろうかと思います。
電話対応が必要ない部署にいれば、その作法が身についていないことはあるかと思います。
その場合には、電話対応についての講習や研修もありますので活用することは方法になるかもしれません。
社内メールについては、その文章や業務連絡だけであれば、堅苦しくしない会社もあれば、いろいろなので、メールについてその内容等で問題があれば、それは御社のルールがあればそれを説明するしかないと思います。
会社が稼いでいるから研究職が～、については、どのような問題があるのかが、ちょっとわかりません。
会社が初期の研修をおこなっていないことが、ヨセミテ２さんにとって問題であるのならば、その点を会社として対策が必要なようにも思えます。

社内メールも、社外メールも一応ビジネス文書ですので、ビジネス文書の書式フォーマットを活用する方法も有ります。。。
友達同士のメールなら、だらだら打ち込んでも良いでしょう。
でも仕事としてメールのやり取りをするのであれば、書き込みのような書き方はタブーでしょう。

研究者だから、メールマナーが悪くても良いということはありません。
どんなに立派な研究であっても、その内容が相手に伝わらなければ意味がありません。文書ならなおさら、相手に伝えることはとても困難です。それも簡潔に、簡単に、そして短文で。。。何百ページにもなる論文ではないので。。。

ビジネスマナーやビジネス文書の参考本など山ほど出ていますので、参考にしてみてはいかがでしょう。。。


> 「メールはこうしたほうがわかりやすいよ」には「私のメールが読みづらいってことですか！」のような感じで指導にもっていけません。

参考文献「まんがでわかる伝え方が9割」・・・結構役に立ってます。読んでみてはいかが？