有給休暇の発生前に休んだ賃金について

貴社の賃金規則によると思います。
もし明確な規則がない場合は、前例を確認することが必要だと思います。

ちなみに弊社では、「月給者」欠勤はの該当月の所定日数の半分を超えて「欠勤」が発生した場合、基準内賃金の１０％減額、全欠勤の場合２０％減額としております。
ただし賞与には大きく反映されてしまいます。
弊社は製造業で、工場現場職などは一部「日給月給制」の社員もおり、その場合は欠勤があれば１日単位で日割り減額となります。