代表取締役欠席のの株主総会での委任状

まず、株主総会の議事を開くには、定足数を満たす必要があります。

定足数を満たすには、原則として、議決権を行使することのできる株主の議決権の過半数を有する株主が出席する必要があります。

そこで、委任状を含め過半数を満たせば株主総会は成立します。
定款を変更するには、当該株主の議決権の３分の２以上の賛成（特別決議）が必要となります。

さらに、総会の２週間前までに株主に対し招集通知を発する必要もあります。
なお、取締役会非設置会社については、総会の１週間前でも問題はありません。

定款を変更する場合は、招集通知にその旨を記載しなければなりません。

以上のことをクリアすれば、法的に問題はありません。

個人的な意見ですが、よほどの事がない限り、代表取締役は株主総会には出席し議事を監視するべきだと思います。
株主総会は、会社の最高意思決定機関でありますから。