在職老齢年金

> しかし、基本月額が一度支給停止等で減額を受けた場合、基本月額は下がったまま戻らないのでしょうか？

総報酬月額は、その月の標準報酬月額とその月以前の1年間の標準賞与額の合計額÷12で計算されますので、標準報酬月額の改定があるか、対象となる賞与が変わると、一部支給停止額が変わる可能性があります。

> また、この方々の交通費ですが、月収は交通費なども含まれた総額ベースとなっていると思いますが、給与明細に非課税の非と記入してありました。これはどういう意味なのでしょうか？

給与明細の発行元に聞かれるのが確実ですが、おそらく交通費が非課税範囲内だということでは？
http://www.soumunomori.com/column/article/atc-1623/
(注：ガソリン代の場合は続きに記載があります)