休職時の控除額支払いについて

> ９月末よりうつ病にて休職しております。
> ９月は全額給料の振込みを頂きましたが、返金を依頼されました。
> 現在は傷病手当の支給を頂いておりますが、マイナスなので
> 高額な支払いが一括に出来ず、分納払いをお願いしましたが
> ルールでは一括のみということで応じて頂けませんでした。
> 支払いが出来ない場合はどうなるのでしょうか？

こんにちは。
ご質問の意味がいまいち良く分かりません。高額な支払とありますが、傷病手当金の額よりも高額となるものとは何なのでしょうか。

傷病手当金は、よしぴーさんの標準報酬月額のおおよそ３分の２が支給されます。
仮に200,000円の等級であれば130,000円位にはなるはずです。決して社会保険が控除できない数字ではないと思います。

何か個人的に加入されている生保や損保が団体扱いとして給与から控除するものがあり、それらが控除できないというご質問なのでしょうか。