パートの妻の所得税

配偶者の方の年間所得金額が３８万円以下の場合は配偶者控除を受けることができます。
　この場合、パートの方ですと給与所得控除がありますので、給与収入が１０３万円以下ですと所得が３８万円以下になりますので、配偶者控除が受けられます。
（参考）
タックスアンサーhttp://www.nta.go.jp/taxanswer/shotoku/1800.htm

今回のケースでは、奥様が確定申告をしているかどうかを問わず、１０３万円以下ですので、配偶者控除が適用できます。

尚、奥様は会社から源泉徴収票をもらっていると思いますので、それに税額の記載があれば、還付申告をして返してもらうことができます。

以上、わかる範囲ですが、参考までに。

ありがとうございます。
助かりました。