有給休暇取得について

自宅待機開始から退職まで自宅ですか？
休業手当ては受領していますか？
上記であれば年次有給は取得できないと思います。
途中待機を止め、有休取得にするのは可能でしょうが、会社と話さないと結論出せない内容です。
（会社とすれば待機なら６０％以上、有休なら１００％ですから有休にはしたくないのでしょう）。
又、やめる事の話は退職日の３０日以前にしてますか？してなければ予告手当て支給対象になりますが！！（会社から退職を言い出した雰囲気ですので）。

> 自宅待機開始から退職まで自宅ですか？
原則自宅にいることになります。
　質問と別件になりますが、会社から技術習得の為（会社はソフトウエア関連の会社なので・・・）自己学習を命じられています。自宅にいなかったことが発覚したら給与が減額されるとも言われています。今回の自宅待機には不可解なことが多いのですが・・・
> 休業手当ては受領していますか？
　休業手当が支給されたとのことでしょうか？
　会社からまだ支給はされていないです。

> 又、やめる事の話は退職日の３０日以前にしてますか？
　はい３０日前になります。ただし、給与は基本給の６割になると思われます。

待機理由は別にしても６割支給なら、休業補償対応していると思われます。
この様な状況の会社であれば、１６日分は有休で１００％下さいとの交渉は難解かと思いますが、交渉はしてみるべきでしょう。
そのままでは、「権利放棄」となってしまいます。
休業補償６０割以上は規程上の料率で、いなかったから減額は違法です。