特別徴収税額決定通知書

特別徴収は6月の給与より控除が始まっています。
会社には5月末頃には通知が届いていますので、対象者には配布されるはずですが、お手元には届いていないのでしょうか？

手元に届いている通知書と会社に届く通知書の違いはほぼないと思います。地域によって若干フォーマットは異なりますが、書かれている内容に違いはありません。

また、税務署にも役場にも、賃金台帳等の月々の詳細を提出しているわけではありません。

それと、前年の収入が、今年振り込まれたのであれば、それは今年の所得に加算され、昨年の所得には反映されません。
所得は、1年分(1月～12月）の結果で決定されますから、年をまたぐことはありません。
年度と、年分の違いにも注意しましょう。

特別徴収税額決定通知書の所得金額は前年分（一年分）の合計金額しか表示はありません。
この基となるものは、年末調整時の源泉徴収票や確定申告です。
月々の詳細の表示はありません。

副業の３万程度の上乗せならば、会社が気付くかどうか…微妙かと。
そこまで金額チェックをするほど会社も暇ではナイとも思いますよ。

ただ、数十万単位で増額があれば、特徴税もそれなりの増額となり、気付かれるかもしれませんけど。