変則勤務の有休付与について

初めまして。質問させて頂きます。
現場の方達の給与を担当させて頂いてる者ですが現場は12箇所くらいありほとんどの現場が変則勤務で、早番、中番、遅番で分かれてる現場もあれば◎○△▲●勤務のように５パターンくらいに勤務が分かれてる現場もあります。勿論勤務パターンごとに日給が異なります。一人の方が早番を月５遅番6中番3、月合計出勤日数＝14日という様なかたちです。
今まではその方の１年間の勤務日数と勤務年数の合計で有休を付与しておりましたが、ある従業員の方から早番と遅番は金額が違うのだから
有休も早番何日、遅番何日と分けて出して欲しいと言われました。現場は全部ローテーションで勤務しており勤務予定表を
作る際には従業員の方の都合を事前に聞き考慮して作成してるので基本的には急病などの理由が無い限りあまり皆さん有休を
取りません。会社は有休休暇が取れるのは勤務表の勤務該当日に
限るとしていますので予定表の早番の時に急病で有休を取れば
早番の金額を支払うというかたちです。
この有休の付与の方法は間違っているのでしょうか？
従業員から申し出があったように遅番何日、早番何日と1年間の
勤務パターンを細かく計算して付与しなければいけないのでしょうか？
どうぞ宜しくお願い致します。