育児休業申出書の添付書類について

育児休業は、労使協定を結ぶことにより、一部の方を育児休業の対象から除外することができます。
そして、その除外可能な対象者として、以下のようなものがあります。


労働者の配偶者で当該育児休業申出に係る子の親であるものが、常態として当該子を養育することができるものとして以下該当する場合における当該労働者
　①職業に就いていない者（育児休業により就業していない者を含む）であること
　②心身の状況が申出に係る子の養育をすることができる者であること
　③6週間（多胎妊娠の場合にあっては14週間）以内に出産予定でないか、
　　または産後8週間以内でない者であること
　④申出に係る子と同居している者であること


簡単に言えば、
もう片方の親（今回のケースで言うとご主人）が常時子を養育できる場合には、
その従業員（今回のケースで言うとももさん）は育児休業の取得対象から除外しますよ、ということですね。
おそらく御社には上記のような労使協定があり、
①に当たらないことを確認するために在職証明書の提出を求めているのだと思います。
したがって、御社に上記のような労使協定があるのであれば、
育児休業と無関係ではありません。