本社と支社で異なる健保組合に加入することは可能？

健康保険の加入は事業所単位ですから、
事業所によって加入する健康保険が異なっていても問題はありません。
ですので、東京の事業所のみ健康保険組合に加入するということも可能です。
ただ、加入している健康保険が異なることによって、
会社の事務処理の仕方によっては、処理が煩雑になることも考えられます。
（たとえば、全事業所の給与計算や保険処理を1つの事業所で一元管理しているようなケースなど）
まあ、協会けんぽでも保険料は管轄地域ごとに違っちゃいますから、
どちらにしても多少の煩雑さは避けられないのですけどね。

あと、東京の事業所が加入を考えている健康保険組合では、
大阪の事業所が管轄区域外のため加入できないとのことですが、
これに関しては、健康保険組合によっては、
事後に大阪の事業所を編入させることが可能なケースがあります。
というのは、その健康保険組合に加入している会社の関連会社に限り、
管轄区域外でも包括的に編入できるという規定になっているところもあるからです。
（その関連会社間に財務的に深い関連性がある、同一業種の事業所である等、一定の要件を課しているケースが多いようですが）
そのような場合ですと、東京の事業所をその健康保険組合に加入させたあとであれば、
大阪の事業所を同じ健康保険組合に編入できる可能があります。
このあたりは、各健康保険組合の規定によりますから、
どの健康保険組合でもできるということではないですし、
大阪の事業所が包括的に加入が認められる要件を満たすかどうかという面もありますから、
東京で加入を検討している健康保険組合に確認してみてはいかがでしょうか？

Maria様

ご返信が遅くなり申し訳ございません。
大変参考になるアドバイスをありがとうございました。

> ただ、加入している健康保険が異なることによって、
> 会社の事務処理の仕方によっては、処理が煩雑になることも考えられます。
> （たとえば、全事業所の給与計算や保険処理を1つの事業所で一元管理しているようなケースなど）
> まあ、協会けんぽでも保険料は管轄地域ごとに違っちゃいますから、
> どちらにしても多少の煩雑さは避けられないのですけどね。

仰るとおりですよね。
煩わしさが懸念材料としてあがっています。
実質、遠隔で一元管理する事になりますので
二つの作業を同時に進める必要がありますので不安はあります。

>
> あと、東京の事業所が加入を考えている健康保険組合では、
> 大阪の事業所が管轄区域外のため加入できないとのことですが、
> これに関しては、健康保険組合によっては、
> 事後に大阪の事業所を編入させることが可能なケースがあります。
> というのは、その健康保険組合に加入している会社の関連会社に限り、
> 管轄区域外でも包括的に編入できるという規定になっているところもあるからです。
> （その関連会社間に財務的に深い関連性がある、同一業種の事業所である等、一定の要件を課しているケースが多いようですが）
> そのような場合ですと、東京の事業所をその健康保険組合に加入させたあとであれば、
> 大阪の事業所を同じ健康保険組合に編入できる可能があります。
> このあたりは、各健康保険組合の規定によりますから、
> どの健康保険組合でもできるということではないですし、
> 大阪の事業所が包括的に加入が認められる要件を満たすかどうかという面もありますから、
> 東京で加入を検討している健康保険組合に確認してみてはいかがでしょうか？

こちらも、問合せをいたしましたが、
現状は、大阪の加入は駄目でした。
せっかく貴重な情報をいただけたので残念でした。

この度は、親身になってご相談に乗っていただき、
改めまして、ありがとうございました。