通勤手当の計算式について

マイカーは難しいですよね。私も頭を悩ませてます。
計算根拠は、それでみんなが納得してもらえるのであれば良いと思いますが、それは会社によって異なりますからね。出来る限り、公平な立場からその根拠が立証できる形にしておく方が、後々問題になりにくいと思います。
もう１つの問題は、その金額が「非課税限度額を超えているのかどうか？」というところもあると思いますので、それも注意した方が良いですよ。

ちなみに私たちの会社では、

（往復通勤距離(実測)÷平均燃費）×全国平均ガソリン単価×年間平均労働日数

というような感じで出しています。詳細は、
・往復通勤距離は、本人申請と「キョリ測」というネットで距離を測定できるものがあるので、それで確認しています。
・平均燃費は7km/l（あまり根拠はないのですが、都市を走行するのにこれくらいはかかるかなぁ、程度で決めてます）
・全国平均ガソリン単価はネットで調べて、現在は134円で計算しています。
・年間平均労働日数は、年間労働日数÷12ヶ月で出しています。

あくまで私たちの会社のことですが、お役に立ててもらえると嬉しいです。

御丁寧にありがとうございます。今後の参考とさせていただきます。
実は、当社の現行の算出方法で、ある職員では自宅からの距離が他の職員より近いにも関らず割高（バスの乗り継ぎによって運賃増）になっている問題が発生しています。
riseさんの会社のように車での実測をもとに算出する方法が無難なのかもしれないですね・・・。ありがとうございました。