ストレスチェックの実施について

> 会社がどの程度まで関与していいのかよくわかりません。

お知恵をといわれても、調べるサイトは用意されているのですからあたりましょう。

http://www.mhlw.go.jp/bunya/roudoukijun/anzeneisei12/

厚労省　ストレスチェック　解説をお読みください。Ｑ＆Ａもあります。

確認ですが、５０人以上と言っても、企業規模でなく、１の事業場所属人数です。であれば衛生委員会設置義務事業場でもあるわけですが、今回こういう形でやりますと、あなたの所属が管理部門なのでしょうから、立案した物を審議評議してもらうことになります。産業医にどうからんでもらうかも事前要調整です。

集計も人海作戦でやるわけでない（まさか１の事業場に千人単位が出入りする大企業というわけではないですよね？）ので、管理部門の小人数指揮して集計すること、指揮するのは人事権者であってもよいのですが、実際の集計にタッチしないことに十分留意する、ということでしょう。