二重で税金を支払ったことになる？

> 奥さんが旦那の被扶養者であると信じ旦那の給与から源泉徴収された税金と、奥さんが就職先で支払った税金との関係はどうなるのでしょうか？さかのぼって何か手続きをする必要があるのでしょうか？

奥様のほうは、就職先で源泉徴収と年末調整がされているなら特に手続きは必要ないでしょう。
問題は旦那様のほうですが、
御社では奥様が配偶者控除の対象者であるものとして旦那様の年末調整をされたということでしょうか？
もしそうであれば、奥様のほうの昨年の収入をご確認ください。
奥様の収入によっては、税法上の配偶者控除や配偶者特別控除は受けられないことになりますので、
もし奥様の収入が基準額を超えているのに旦那様のほうの控除対象者となっている場合は、
旦那様のほうの修正申告をする必要があります。
これは、二重に税金を払ったということではなく、
旦那様が支払うべき税金が不足しているということになります。
（控除すべきではない分まで控除されているので、その分にかかる税金が不足）
奥様の収入に合った正しい処理がされている場合はそのままでかまいません。

わかりやすい回答ありがとうございました。早速調べてみます。