36協定の特別条項適用で延長した限度時間をさらに超えた場合

まず３６協定の基本は「事前協議」です。
協定時間を越えてから協議するのではなく、超えそうになったら、労使で話し合うことが原則です。
（ただ、実際はほとんど事後の場合が多いようですが・・・）

当社の経験からお話しますと・・・

　今回の１８０時間を越えてしまった場合は、明らかに労基法に抵触します。ただし、別に労基署に自ら申告することは義務付けられていないことから、すぐに罰則が適用されることはありません。
　それより、労働者側としては、会社側に、
（１）再発防止策
（２）本人への健康面でのケア（産業医面談等）
の２点を厳しく申し入れるべきです。
　この点について会社側が真摯な対応をしてもらえれば、一応の治まりが付くことになります。
[了承]はここまでしてもらってからになります。ただし、ここでいう「了承」は、法令違反を容認するということではなく、会社の対応を了承するということです。
　労働者側からは　そういうスタンスで臨めばいいと思いますが・・・。

ご回答ありがとうございました。

当社でも事前協議の徹底は日々行われておりますが、
今回の場合突如作業が発生したことにより結果限度時間を
超過することとなってしまいました。

労基法に抵触するということは納得ですが、かといって
自ら申告することは義務付けられていないとのこと･･･
つまり、当社としては組合と話し合いをし、再発防止策を
講じていれば問題ないということでしょうか。

もちろん、事後報告となっても組合との協議は行いましたので
今後このようなことがないようしっかりと対策を講じようと思います。

ちなみにお聞きするのですが
O822さんは　会社側の立場の人なのか社員側の立場の人なのか　どちらでしょうか？

　最初の質問では労働者側の立場と思っていましたが、今回の質問は会社側の立場での内容です。
　法令遵守という前提はどちらも必要ですが、アドバイスする場合はどちらなのかで弱冠変わってきます。

いちおう後者を前提として・・・
　内部統制はしっかりされているようですので、あとは労使協議の内容や再発防止策とその実施内容の記録を残しておくことが大切です。

　万が一、労基署の監査が入っても、このあたりの記録があり対策を講じていれば、注意くらいで特に罰則をうけることはありません。
　それより、過重労働によるメンタルへの配慮だけは、お忘れなきよう。
　　　　　　　　　　　　　　　　　以上