傷病休暇→産休→育休

はじめまして。
お体の方は大丈夫でしょうか？
労務担当をしております。

傷病休暇中とのこと。健康保険に加入していらっしゃれば、傷病手当金の申請をすることができます。書類は3ヶ月間くらいまとめて請求できますが、1日単位で請求可能です。事務処理を考えれば、数ヶ月まとめて申請いたします。
産前産後休暇に入れば出産手当金に切り替わります。出産日前42日間以内の休業であれば出産手当金になるはずですので、傷病手当金の申請をするより出産手当金の申請をしたほうが良いでしょう。
出産日以後56日間は出産手当金になります。
当社では、産後以後56日を越えてからまとめて申請しております。（その方が一度の手続きで済みますので）
すべて暦日で計算しますので、今一度出産予定日等をお調べください。
また、傷病手当金及び出産手当金の申請には専用用紙に医師の証明を記入していただく必要があります。
まずは、傷病手当金がもらえるのではないか等の相談を会社にしていただき、用紙を会社からもらって医師に記入していただいてから、申請ができます。
再度、会社に問い合わせてみてはいかがでしょうか？