交代職場の欠員は労基違反になる？

私見です
現状で年間360時間の残業時間を超えそうだというだけでは違法とまでは言えないでしょう。

また、36協定の特別条項を結んでいれば、最大で年間720時間まで残業させることができますので、実際に360時間を超えたとしても違法ではない場合があります。

ありがとうございます。

特別条項記載にて、「臨時的な特別の事情」との記載があり、年間を通してまたは数年間にわたり、適切な人員配置を行わなれない事は、臨時的な事情とはならないと思うのですが、それでも違反とならないのでしょうか？

またはそういったような事例はないのでしょうか？

おっしゃるとおり、長年人員不足が続いている場合、人員不足だけが残業の理由なのであれば、特別の事情にはあたりませんので、その状態で年間360時間を超える残業をする場合は違法となります。

ただ、この場合においても360時間を超えることが確実だ、というだけでは違法にはなりません。
実際に超えたら違法です。