雇用保険について教えてください。

ご質問は、会社従業員間の保険料のことでしょうか？
それとも、会社政府（保険者）間のご質問でしょうか？

前者は、従業員への月ごとの支払い（含む賞与）の支給総額が確定すれば、本人負担の保険料は確定しかつ源泉します。

後者は、１年度ごとに労働保険料確定申告書が送付されて来るので、それで過年度（去年４月から今年３月）分の精算（確定）と、今年度分（今年４月から来年３月までの概算）保険料を納めます。毎年、前年概算で先納付した分を今年精算する繰り返しです。

上の記述を頭に入れていただいた上でご質問に直接答えると、年度途中で退職された人の先納付した概算保険料は、政府（保険者）に対して納めすぎとなりますが、年度がかわって確定申告するまで取戻しはありません（例外有）。実際おさめすぎとなった分は、次期概算保険料に充当することになります。

年度途中で新規採用した場合は、その年度の先納め（概算）に計上されてないだけで、個人負担分は月ごとの給与支払いからその都度徴収する（会社経理上、預り金処理）となります。これにも例外があり、大量中途採用することで、次の確定保険料がすでにおさめた概算保険料の２倍に見込まれる場合は、概算を追加納付することはあります。この例外に該当すれば、ご質問にあるように政府への会社立て替え払いとなるでしょう。

個人名と保険料とが紐づけられている社会保険料（健保＋厚年）とは、違う納付方法ですので、切り分けて理解なさってください。

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