フレックスタイムの総労働時間

月間に（休暇でなく）休日が何日あろうと、その法定の総労働時間は、暦日数できまるのであって、増加減しません。

暦日数×４０÷７

この時数を超えると、３６協定の時間外労働のカウントが始まり（法定休日労働を含めず、別途休日割増賃金支払い）、法定の時間外割増賃金の支払いを強制されます。

おそらくお尋ねの向きは、そんなことでなく月間の所定労働日数から何時間働くこととするのか、という設定のことでしょう。それは、上の法定総枠をこえることなく、フレックスを許容するとした労使協定に盛り込まねばならない事項です。労使協定をご覧ください。