休日出勤？の振替について

賃金をいかに支払うかは、御社の就業規則に聞いてください。ここに訊かれても御社の規則を知る人はだれもいません。

法が賃金支払いを規定（規制）しているのは、最低賃金と時間外労働・法定休日労働の割増賃金だけだからです。

処理法…と、問われたら前出の投稿者様の投稿通り「御社の給与規程」に則った計算方法を、となりますが…。

先ず、毎日の遅刻から正す必要があると思いますが。
また、何故土曜に2時間だけ出勤するのか？その必要があるのか？？
上司などその社員の勤怠を管理する人は居ないのでしょうか？？

それらの部分の注意喚起から始め、改善がみられなければ何らかの就業規則に則った罰則を…という見解になるでしょうか。