遅刻と早退の扱いについて

本質問は、何を求めているのかがよくわかりません。

控除以外にいい運用方法とおっしゃいますが、
貴方が考えるところの「いい運用方法」とは何ですか？
ノーワーク・ノーペイなのですから、働いていない分の
賃金が支給されないのは当たり前です。良いも悪いもありません。
この当たり前のやり方は、良くない運用方法なのですか？

何を主眼に置いた答えを求めているのかを示して
いただかなければ、誰も適切な回答はできないと思います。



蛇足ですが

> ただ、半日有給にしてしまうと、15分の遅刻で済む場合にも、
> 「どうせ半給なんだからお昼から出社しよう」となってしまうのでは
> ないかと心配です。

半日有給として当たり前の権利が行使されているだけの話です。
これも、何が心配要素なのかが分かりません。

Ditaさまが回答されている通り、何をもって、いい運用なのかは不明です。
御社の状況に合わせていくしかないと思います。

なお、
年次有給休暇は、原則、労働者側の請求がなければ付与できませんので、遅刻＝年次有給休暇という取扱はできないと思われます。

遅刻した社員が、有給休暇で対応して下さい。と請求してきた場合に、事後請求の有給休暇を認めるかどうかは、御社次第です。

Dita様、ﾕｷﾝｺｸﾗﾌﾞ様

ご回答いただきまして、ありがとうございます。

働いていない分、賃金が発生しないのは当然のことである
とわかっているようでわかっていませんでした。
精進いたします。

有給についてもありがとうございました！
柔軟に対応できるよう努めてまいります。

ありがとうございました！

知人の会社ですが。。。

通常の月給では、遅刻は控除しない、、、が賞与で差をつけるそうです。
遅刻回数によって、賞与額が減っていく仕組みになっているようです。。。遅刻しなかった人は上乗せがあるようです。
参考までに。。