役職手当を固定残業代とする場合

マクドナルドの店長を管理監督者と認めず→（結論として）残業手当を支払い。
その他行政官庁（所轄労働基準監督署）の指導により、管理監督者の定義が厳しく指導されています。
役職手当に割増賃金分を含んでいる形にて支給したい、それは可能ですが、一番肝心なのは、管理監督者の定義を就業規則に明確化することです。（行政通達に適合）
管理監督者では無い方に、割増賃金分（例えば、４５時間）を含んでいるとして役職手当を支給されても、現実９０時間残業されていれば、当然、超過部分の４５時間については残業手当を支払わなければ、賃金不払いとなります。
この際、管理監督者と管理監督者以外（一般の役職者）の方を明確に就業規則において分けて定義され、役職手当を支給されることです。そうしますと、役職手当の額はだいたい決まってきます。なお、管理監督者であっても、深夜労働（２２時から５時まで）に対しては残業手当は必要です。
いずれにしましても、現在ご検討されておられます、役職手当（但し、残業手当○○時間を含む）は、効力をなさない場合が発生します。また、何時間相当分と明示されても、役職手当である以上、その相当分未満の残業時間月であっても、役職手当支払い義務があります。
よって、今回の改定案は再検討が必要です。

藤田行政書士総合事務所
行政書士　藤田　茂
http://www.fujita-kaishahoumu.com/

藤田様

ご回答いただき、ありがとうございました。
また、お礼が遅くなり申し訳ございません。

再検討をしてみます。