変動労働時間制について

１年の変形労働時間制をする期間を決めなければなりませんから、毎年労働基準監督署へ届出が必要です。
毎日の労働時間は御社の所定労働時間で、１年間の休日をカレンダー表で従業員に提示すればわかります。
総日数は給与の締めでするのが計算がし易いのでそのようにされたらいいでしょう。
例えば１年の変形労働時間制の期間がH21.5/21～H22.5/20とされ　40×365日÷7＝2085時間42分以内（一日の所定労働時間×年間所定労働日数＝2085.時間42分以内）　に年間所定労働時間にしなければなりません。そして、それについて労使協定を結び労働基準監督署へ届出をします。

ありがとうございます。

確認なのですが、期間途中で入社した人については、
入社日から期間の終了日までを総労働日数として
計算式にあてはめて時間を算出すれば良いのですよね？
そして、その時間を超えた部分に対して
時間外手当を支給するのですよね？

また、これらについて労使協定を結び
労働基準監督署へ届出をしなかった場合は、
無効と言う事で宜しいでしょうか？

変形期間中の途中入社、途中退職者等については、実際に労働した期間を平均して１週間当たり４０時間を超えた労働時間分について賃金規程の割増賃金を適用し精算します。
「１年単位の変形労働時間制に関する協定届」を労働基準監督署へ届出をしなかった場合は無効ですね。