解雇予告とうつ病

本人が診断書を提出されたのは休職を希望されたのではないでしょうか。
就業規則による休職規程により処理され、その期間の賃金は必要ありません（傷病手当金）ので新たに採用されたらどうでしょうか。
休職期間が満了した段階で、診断書により職場復帰できるか
休職期間の満了をもって退職になるか判断されたらいかがでしょう。

> 解雇予告をしようとしていた社員からうつ病の診断書が提出されました。
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> 解雇事由は、欠勤や遅刻、早退が多いこと。協調性やコミュニケーション上のトラブルの多さ、執務態度での再三の口頭注意でも改善が見られないことの２点です。
> あまりにも自己中心的な言動が多く、他の社員にも悪影響を与えていたため、本人に説明をしたうえで解雇予告の通知を検討していた矢先に、本人がうつ病の診断書を提出してきた次第です。
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> 本人の希望としては、休職し治ったら職場復帰したいというものでした。ただ、うつ病の原因については話したくないとのことです。
> 職務内容は事務（主に来客対応、電話対応、庶務等）で、この１年間の平均残業時間は０～２時間／月程度で、有給休暇の取得率も１００％、業務が原因とは考えにくいというのが私の見解です。
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> １５人の事業場であるため、産業医の選任はしていませんし、恥ずかしながら会社に担当医がいるわけでもありません。
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> このような場合、会社としてどのような対処をするべきなのでしょうか？
> このまま、解雇予告を出してもよいものなのでしょうか？
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> 少ない人数で業務を遂行しているため、出勤があてにならないようなら代替要員の採用もしなくてはいけませんが、会社的に余裕があるわけでもないので、辞めることが確定してからでないと進めることもできません。
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> 以上、お知恵を貸していただければと思い、ご相談させていただきました。宜しくお願い致します。

こんにちわ。
御社の就業規則はどうなっているのですか？
御社が欠勤→休職期間満了退職となっているならば、その手順に従うまでです。

ただ、当社にもうつ病の社員がいますが、休職期間が満了＝退職とすんなり行かないものです。

復職の基準が明確になっていないと問題となります。

会社としては、病気する前の状態に戻ること。
本人は、会社に出勤できること。

このあたりが文書等ではっきりしていませんと、休職期間満了時にすんなり退職とならないことになります。
注意してください。

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