最低賃金の計算方法

こんにちは。
固定残業手当は、最低賃金の計算に際し、対象外となりますので、ご質問例でいいますと、１４万円の賃金と実労働時数とを用いて計算することになります。
ただ、月給者の場合の時給換算については、毎月勤務日数や勤務時数が変動していて一律でないものの、給与は毎月一律というケースがほとんどです。
よって、「月給÷１給与月の平均所定労働時間」という計算式で計算することになります。

ご質問文からは、都道府県や１給与月の平均所定労働時間がわかりませんが、仮に最低賃金が時給７００円の都道府県として割り戻すと、
１４万円÷７００円＝２００時間
より、１給与月の平均所定労働時数が２００時間以下であれば、最低賃金をクリアしていることになります。

固定残業代が支給されているとのことですが、何時間分の残業手当なのでしょう？
ご質問文より、４０時間分の残業手当相当額と想定しますと、
７００円×１．２５×４０時間＝３５０００円
となりますので、４万円が支給されているのならば、クリアできていることになります。
ただし、これはあくまでも最低賃金＝実際の時給だった場合の話です。
仮に、「月給÷１給与月の平均所定労働時間」で計算した額が８５０円だったとしたら、
８５０円×１．２５×４０時間＝４２５００円
より、固定残業手当は４２５００円以上に設定する必要があります。

また、特段の指示がない場合、所定時間外労働以外の割増分（休日割増の対象になる労働や深夜労働）は固定残業手当には含まれていませんので、このような労働に従事した場合には、別途実労働相当額を支給しなければなりませんので、ご注意ください。
ちなみに「特段の指示」というのは、
「固定残業手当は、休日勤務○時間分，深夜勤務○時間分，所定外勤務○時間分とし、これを超過した分は別途支給する」
というようにきちんと明記していることを指します。

「固定残業手当を支払っているから、いくら残業しても手当は支給しない」
ですとか、
「今月の残業時間は３０時間だったから、１０時間分を差し引く」
「先月の残業時間は３０時間で１０時間足りないから、今月は５０時間残業してもらう」
というようなことはできません。

ご参考になる点がありましたら幸いです。

わかりやすい解説ありがとうございます。
そうなると、どの計算式に当てはめても最低賃金を下回るという結論になりました。

会社の労務担当者から、固定（残業代）で支払っているんだから、合計で考えればいいんだよ。問題ない。と言われたのですが、どうも腑に落ちなくて質問させていただきました。
再考してもらうよう上司に相談します。
ありがとうございました。