会社側がどのような意思をもって秘書を雇っているかということではないでしょうか。言い換えれば、どのような契約をしているか、ということであり、社員あるいはパートとして”雇用”しているのであれば当然、雇用契約が存在し雇用されたものは就業規則に従うことになるし、請負ということになれば請負契約に従って業務を行ってもらい報酬を支払う、ということになるかと思います。雇用も請負あるいはその他形態(アルバイトなど)も会社と個人間の契約に基づくものである以上、契約というものが前提にあっての雇用(あるいは請負、アルバイト等)ということになるかと考えます。