有給休暇の時間

変形労働時間制の場合、
年休取得時の賃金は「各日の所定労働時間に応じて算定」という解釈例規があります（昭６３・３・１４基発１５０号）。または、「通常の出勤をしたものとして取り扱う」（平２２・５・１８基発６７５号）など。

所定労働時間が異なる場合に、１日の支払額を統一したいのなら、
「通常の賃金」ではなく、平均賃金や標準報酬月額基準という方法も考えられるところです（労基法３９条７項）。法律上は、１日８時間に統一して処理という選択肢は書いてないようです。
しかし、平均賃金とかがよいかというと、「痛しかゆし」で、
メリットデメリットをよく考えてから、決断されてはと思います。見当はずれの回答でしたら、ご容赦を。



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有給休暇の時間を正社員全員を８時間に統一したいと考えております。
> １年間の変形労働時間制を採用しているのですが
> 所定労働時間９．５時間の日に有給を使った場合
> １．５時間分足りないので
> 所定労働時間８時間の日に９．５時間働いた際の１．５時間の
> 時間外労働と相殺できますでしょうか？
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1年単位の変形労働時間制であっても、有給休暇の取得は、暦日単位になります。
ゆえに、
> 所定労働時間９．５時間の日に有給を使った場合
所定労働時間が9.5時間の日において有給休暇を行使した場合に、それを8時間として処理することは法律に違反するのでできません。有給休暇の賃金として9.5時間分の賃金が必要になります（労働基準法施行規則第二十五条）。
ゆえに、相殺することもありえません。

統一するのであれば、就業規則の変更が必要ですが、
有給休暇の賃金について、
・平均賃金
・健康保険の標準報酬日額（労使協定による）
のいずれかでの賃金とすれば、8時間相当ではありませんが可能になります。



> 有給休暇の時間を正社員全員を８時間に統一したいと考えております。
> １年間の変形労働時間制を採用しているのですが
> 所定労働時間９．５時間の日に有給を使った場合
> １．５時間分足りないので
> 所定労働時間８時間の日に９．５時間働いた際の１．５時間の
> 時間外労働と相殺できますでしょうか？
>

「賃金」、「時間」、休暇日のなんの過不足の相談なのでしょう。タイトルは「時間」であり、本文には「賃金」の「ち」の字も出てこない。

「賃金」なのか「時間」なのか、もし両方なら、しっかり書き分けて質問いただきたいものです。