1ヶ月の変形労働制の休日日数について

労働条件を定める就業規則の変更については、労働契約法に次のように定められています。

（就業規則による労働契約の内容の変更）
第九条 　使用者は、労働者と合意することなく、就業規則を変更することにより、労働者の不利益に労働契約の内容である労働条件を変更することはできない。ただし、次条の場合は、この限りでない。

第十条 　使用者が就業規則の変更により労働条件を変更する場合において、変更後の就業規則を労働者に周知させ、かつ、就業規則の変更が、労働者の受ける不利益の程度、労働条件の変更の必要性、変更後の就業規則の内容の相当性、労働組合等との交渉の状況その他の就業規則の変更に係る事情に照らして合理的なものであるときは、労働契約の内容である労働条件は、当該変更後の就業規則に定めるところによるものとする。ただし、労働契約において、労働者及び使用者が就業規則の変更によっては変更されない労働条件として合意していた部分については、第十二条に該当する場合を除き、この限りでない。


従業員代表が合意したのなら、変更は合法に行われたことになります。

ただし
>主任（管理職）が職員代表となり調印となりました。
通常、管理職は従業員代表とは認められません。主任が法でいう管理職かどうかですが。
http://www.soumunomori.com/forum/thread/trd-39099/

法にありますように、一定の条件が揃えば、従業員代表の合意がなくても就業規則の変更は可能です。
変更が一方的に不利益を強いるもので合理的な理由がないのであれば、合意しないことです。