半日有休と重なった勤務時間について

総務の森：コラムの泉
半休取得後、残業をしたときの割増手当はどうなる？
http://www.soumunomori.com/column/article/atc-38498/
が参考になるかと思います。

「8:30～17:30を超えての勤務については時間外手当を支給する」など就業規則でうたっている場合は、規則どおりとなります。
googleキーワード「有給　時間外」での検索結果でトップでヒットしたサイトをご参照ください。

ご回答ありがとうございます。

その辺りは既に読んだのですが、弊社の
「実労働時間と有休取得時間が重なっている（本来13時以降は有休のはずが、14時半まで労働している）」
ケースの場合も同じように「13:00～14:30も時間外勤務」
と捉えてよいのかが解らないのです。

午後半日休暇を申請しているのに１３：００以降も勤務が発生していること自体が問題ではないでしょうか。
５：００～８：３０の勤務を前時間外勤務と考えても、半日有給の基点が１３：００であれば同じではないかと思います。

下記について法的な点からなど、間違っていたらどなたかご指摘ください。

例えばですが、
　８：３０～通常勤務する日の服務を臨時に変更して、
　５：００～１４：００の臨時服務（休憩１時間）
１４：００～１４：３０は時間外勤務で１４：３０退社
乱用を避けるため、労働組合対応が必要になるかと思います。

法的には休業手当の支給か早退の扱いになるはずですが、
私としては実務的には、考え方は2つあると思います。
１．「休暇日に出勤したので休暇は取り消される」という対
　　　応。
　　　この場合は、終業時刻までいる必要があります。
　　　しかし、会社が帰ることを許可すれば（早退ではなく
　　　就業免除）法的には休業手当を支給する必要があると
　　　思います。
しかし、早退（一部欠勤）なのに給与を払うという取扱いは無理があります。
よって、
２．「当人が勝手に勤務した」という対応。
　　　この場合は、休暇の付与もでき、別途1時間半の給与
　　　もあれこれ考えなくてすみます。勿論これは法的には
　　　問題があります（サービス労働となる）が、本人は
　　　2時半には帰りたいわけですし（早退扱いはいや）
　　　会社も帰らせることは問題ない、となれば、実務的
　　　な対応といえます。あくまで当人が早退扱いとして
　　　ほしくないのであれば、この取扱いになります。
　　　当人が問題視しないならばですが、当然しないはず
　　　です。

社員にとって法的問題と実務的な対応は若干違うように思えます。それが双方にとってよい方法であれば。

ｍａｆｕｎａ２０１１様、からすみ様、ご回答ありがとうございました。

以前より「有休と勤務は重複できない」と周知はしてあるのですがこのような事になってしまいましたので、
結局当人と話し合い、今回はからすみ様の仰る、２．「当人が勝手に勤務した」での対応とし、今後早退するような場合があれば、その時にこの1時間半ぶんは勤務したとみなす事となりました。