１か月単位の変形労働時間制の導入について

判断するのに必要な情報が欠けていますので、開示されている情報だけで判断します。

１日８時間の所定とのことです（年末年始以外は年中無休としながら休日９～６時の意味不明）。従って変形にする意味はなさそうです。ただその業種で職員数が10人未満なら「特例措置事業場」となりますので週44時間制が利用できます。（ただし不利益変更の手続きが必要ですが）

こういった事情を勘案して回答します。
①　先の説明通り、導入しても意味ないと思われます。というか、できないでしょう。また一旦決めたシフトの変更が何度もある予測とのこと。この点でもできないといえます。
②　上記同様
③　法定労働時間、つまり１日８ｈ、１週40（44）ｈを超えた時間が時間外となります。法定休日はどの日なのかは会社が法基準に従って定めることができます。

> 月途中に度々勤務変更が行われるため導入することが難しいのではないかと、悩んでおります。

変更が生じる事由はなんでしょうか？　当日利用者数が前日にならないと確定しないからでしょうか？　もしそうなら、利用者数の繁閑に応じて人員配置する必要がありながら、繁閑に規則性が見とおせないので、勤務予定表を組む変形労働時間制は無理でしょう。

もし前週にほぼ確定できるのであれば、週４０時間にして、８時間週５コマを各人割り振る勤務予定表をつくればいいのであって、変形労働時間制である必要はありません。それでも月２１勤務を墨守するため、変形労働時間制を組む必要がある（週６日勤務対応）のでしたら、閑の日にあぶれた人を他の日に動かさず、繁の日は、休日出勤指示して応援させ、時間外（休日）割増し支払うしかないでしょう。

１）変動させる事由がなんであるかによって対応のしかたができるかもしれません。

２）変形労働時間制の時間外の把握の仕方は、日、週、変形期間の３段階で色ぬりわけできるように把握します。詳しくは、この労務板随所に書きましたので、「変形労働時間制」で検索してみてください。月枠だけで判別がゆるされるのは、フレックスタイム制だけです。

３）その場合は、日、週の２段階で時間外を把握します。法定休日労働（1.35）にするのは、法定休日指定していればその日、してなければ、その暦週の休日すべて働きにでた最後の休日に対してです。

※補足要求
> 休日9：00～6：00

休日は翌朝６時まで勤務でなく

休日9：00～18：00

が正しいのでは？

村の長老様ご回答ありがとうございます。
休日の件申し訳ありません。
・子供の学校が休みの日(土日祝や長期休暇等)は朝から子供が来るので勤務時間が９時～１８時となります。

・会社の従業員総数が４０名を超えておりますのが施設ごとでは１０名以下です。確かに
　特例事業場として44時間制が適用できるかと思います。

・法定休日については週１日とするの記載のみで、特に何曜日と定められておりません。
　希望休を3日程度きいておりますのでその関係もあり各個人に毎週〇曜を休日と定める
　のも難しいところではあります。

いつかり様　ご回答ありがとうございます。

休日の件申し訳ありません。おっしゃる通り18時が正解です。失礼いたしました。
利用者数については、前月中に利用者から予定が送られてきてシフトを組むのですが、
前日に利用予定の確認と送迎のご連絡をいたします。その際に利用キャンセルをされたり、追加になったり等があります。人員配置基準があり、スタッフのもっている資格や利用者の人数に応じてスタッフの配置を行うために変更が度々あります。(スタッフの体調不良等もよくありますが。)

前日最終確定ですか。　先に書いたヒント程度しかやりようはない、でしょう。

時間外・休日労働の把握については、齟齬を見受けますので是正なさってください。